Під час внутрішньоутробного розвитку через пупок проходять дві пупкові артерії та одна вена. Після народження вена заростає і перетворюється на круглу зв'язку печінки (при портальній гіпертензії може реканалізуватися). Відразу за пупком розташований урахус, який бере початок від сечового міхура.
Якщо нічого не робити, в пупці накопичується бруд, мертві частинки шкіри, бактерій, поту, мила, гелю для душу та лосьйонів. Зазвичай нічого страшного не відбувається, але іноді з'являються струпи або неприємний запах, а також грубіє шкіра.
У якийсь момент під час пологів пуповина перестає виконувати свою важливу функцію щодо перенесення крові від матері дитині. Після пологів її затискають клемами та перерізають. Ті, що утворилися на тілі дитини фрагмент відпадає протягом першого тижня.